Il pilota del team Ktm Ajo ha fermato il crono sul 2:05.913 precedendo per soli 99 millesimi Sergio Garcia (GASGAS) e Jeremy Alcoba (Gresini).
Quarto tempo per Gabriel Rodrigo (Gresini) che chiude davanti a Tatsuki Suzuki (SIC58 Squadra Corse) e Andrea Migno (Snipers) ..
Settimo crono per Darryn Binder (Petronas) davanti a Jhon McPhee e Pedro Acosta (KTM Ajo) Izan Guevara(GASGAS) completa la top ten.
Moto3 Qualifica 2 Losail – GP Doha – I tempi
| Pos | Num | Pilota | Moto | Team | Tempo | Gap |
| 1 | 5 | Jaume Masia | Ktm | Red Bull Ktm Ajo | 2:05.913 | |
| 2 | 11 | Sergio Garcia | Gasgas | Gasgas Gaviota Aspar Team | 2:06.012 | 0.099 |
| 3 | 52 | Jeremy Alcoba | Honda | Indonesian Racing Gresini Moto3 | 2:06.158 | 0.245 |
| 4 | 2 | Gabriel Rodrigo | Honda | Indonesian Racing Gresini Moto3 | 2:06.346 | 0.433 |
| 5 | 24 | Tatsuki Suzuki | Honda | Sic58 Squadra Corse | 2:06.407 | 0.494 |
| 6 | 16 | Andrea Migno | Honda | Rivacold Snipers Team | 2:06.619 | 0.706 |
| 7 | 40 | Darryn Binder | Honda | Petronas Sprinta Racing | 2:06.643 | 0.730 |
| 8 | 17 | John Mcphee | Honda | Petronas Sprinta Racing | 2:06.646 | 0.733 |
| 9 | 37 | Pedro Acosta | Ktm | Red Bull Ktm Ajo | 2:06.829 | 0.916 |
| 10 | 28 | Izan Guevara | Gasgas | Gasgas Gaviota Aspar Team | 2:06.833 | 0.920 |
| 11 | 50 | Jason Dupasquier | Ktm | Carxpert Pruestelgp | 2:06.967 | 1.054 |
| 12 | 23 | Niccolo Antonelli | Ktm | Avintia Esponsorama Moto3 | 2:07.025 | 1.112 |
| 13 | 27 | Kaito Toba | Ktm | Cip Green Power | 2:07.108 | 1.195 |
| 14 | 55 | Romano Fenati | Husqvarna | Sterilgarda Max Racing Team | 2:07.145 | 1.232 |
| 15 | 82 | Stefano Nepa | Ktm | Boe Owlride | 2:07.197 | 1.284 |
| 16 | 43 | Xavier Artigas | Honda | Leopard Racing | 2:07.252 | 1.339 |
| 17 | 6 | Ryusei Yamanaka | Ktm | Carxpert Pruestelgp | 2:07.429 | 1.516 |
| 18 | 7 | Dennis Foggia | Honda | Leopard Racing | 2:07.498 | 1.585 |